Le fort fut construit en 1703 à la pointe Sainte Catherine pour contrôler l’accès à la rade d’Aix, lieu de mouillage de l’escadre de Rochefort.
Un demi siècle plus tard, le fort est détruit par les anglais lors d'une violente attaque de l'ile et il ne sera reconstruit en urgence qu'en 1778 pour faire face à une nouvelle menace de la Royal Navy.
Sous le Premier Empire, le fort est entièrement repris, puis régulièrement modernisé tel qu'on le voit aujourd'hui.
Aujourd’hui, le site se visite librement et on y trouve une résidence hôtelière, un camping et une école de voile.